《矫捷兵士高达F91》的电影版于1991年3月16日上演，影片描述0123年3月16日至3月30日“克洛斯邦·班卡多动乱”（Crossbone Vanguard）期间的故事。 U.C.0123年3月16日，殖平易近卫星FRONTIER SIDE遭到自称C.V（灭亡前锋）的迷之MS军队攻击，造成FRONTIER Ⅳ的 500 多居平易近灭亡、 14 万人出亡。 在出亡的人群中有GUNDAM F91开辟者之一梅凌·亚诺博士的一对后代西布顿（シ—ブック アノ—）、丽诗，和罗拿家族的次女贝拉·罗拿，别名茜茜莉·费尔齐。罗拿家族是 C.V的带领者，倡导贵族主义并欲同一殖平易近卫星、成立宇宙巴比伦空中花圃。茜茜莉的母亲娜迪亚不满于家族的束厄局促而和一名叫史奥·费尔齐的下人私奔，当她发现史奥卑鄙的人格后又抛下本身的女儿不知所踪。当西布顿等人来到船埠，在其父洛士尼·亚诺的带领下登上小型穿梭机时，茜茜莉在其养父史奥的勒迫下，分开西布顿和本身的哥哥度雷一路返回罗拿家。逃到FRONTIER Ⅰ的西布顿一行，碰到了联邦军的操练船舰“宇宙方舟”。 3月19日至22日，C.V开端进攻FRONTIER Ⅱ、 Ⅲ并将其压抑。由于贫乏人手，西布顿他们被拉入联邦军辅佐，也是以发现其母亲开辟的F91 亦在此方舟内（采取了生物电脑的F91，事实上是专为NEW TYPE设计的）。 丽诗还替机械师解答了母亲在F91生物电脑中留下的迷题， 这使得每启动一次就会出故障的F91终究被完成了， 又因“宇宙方舟”上只得比基特一名驾驶员，故西布顿被推上 F91的驾驶舱，他的NEW TYPE能力也开端渐渐地醒觉了。另外一方面，回到罗拿家的茜茜莉遭到祖父马尔捷的强烈热烈欢迎， 并想让她成为宇宙巴比伦空中花圃的女王。被祖父一番辨白感动的茜茜莉剪去长发筹算留在罗拿家，并开端进修驾驶MS，教她驾驶MS的查贝尼（C.V 中最强的“黑之军队”队长）亦发现茜茜莉也是NEW TYPE。 3月26日，C.V的最高批示官铁假面（茜茜莉的父亲，原名卡罗素，因老婆和他人私奔而戴上面具遮丑，乃是强化人类）在FRONTIER Ⅳ颁发宇宙巴比伦宣言。 而西布顿亦趁机潜入罗拿家的别墅，欲带走茜茜莉未果，反而扳连了本身的父亲。回到“宇宙方舟”，和别离多时的母亲相遇，不免责备谴责其母抛下他和丽诗静心于工作中。当西布顿和他的母亲尽释前嫌时，茜茜莉的母亲娜迪亚亦逼着史奥带她去见本身的女儿，并要茜茜莉分开罗拿家。不听母亲劝告的茜茜莉拂袖而去，此时娜迪亚发现站在她身后的史奥已被铁假面所杀，紧接着本身也被C.V的兵士抓了起来。 3月30 日， 不知情的茜茜莉与查贝尼一路受命佯攻FRONTIER Ⅰ，而铁假面则带着他的舰队占据FRONTIER Ⅰ的能量供给装配替其奥秘兵器“巴克”供给能源。查贝尼的手下玛安娜.布尔芝因妒忌其上司对茜茜莉的过度关心而倒戈，投奔“宇宙方舟”，和西布顿等人一同迎击C.V 的“黑之军队”。当安娜玛丽的MS被查贝尼击中后，西布顿亦与茜茜莉的MS比武，所幸最后两人认出了对方，茜茜莉回到西布顿的身边。“黑之军队”撤退后不久，铁假面的母舰上便放出大年夜量“巴克”进入卫星中。“巴克”是一种专门用来杀人的兵器，它能感应人的波长而上天入地将卫星中的居平易近全数杀死！西布顿、茜茜莉和比基特三人奋力抵当“巴克”，却没有多大年夜结果，比基特当场阵亡。西布顿和茜茜莉想法将“巴克”吸引到狭小的通道中令其相撞，然后又炸毁了生产“巴克”的船舰。回到母舰上的查贝尼，知晓铁假面瞒着他和总帅马尔捷制造了“巴克”并诡计以此将月球和地球的居平易近全数抹杀之过后，立即将铁假面的副官正法，并令余下的C.V军队撤离FRONTIER Ⅰ。 发觉到茜茜莉哗变的铁假面末路羞成怒，驾驶着最新的MA“拉夫烈西亚”追击茜茜莉和西布顿。战争初始， F91和茜茜莉驾驶的比维拿.基拿在拉夫烈西亚的强大年夜气力下毫无还手之力，比维拿.基拿被击毁，茜茜莉被铁假面抓出驾驶舱抛向茫茫的宇宙。愤慨的西布顿阐扬出F91 真实的气力，使出有质量的残像“兼顾”将铁假面打倒。战争结束后，及时逃出FRONTIER Ⅰ的宇宙方舟缓缓驶向F91，查贝尼见宇宙方舟上搭载着大年夜量的难平易近，又目击到西布顿掉魂高卑潦倒地四周寻觅茜茜莉的样子容貌，便放过他们带着本身的手下暗暗离去了。西布顿在其母亲的指导下，应用NEWTYPE的感知能力， 终究找到了漂荡在无尽空间中的茜茜莉，两人相拥在一路，其喜悦之情不言而风车动漫